３年次には、「専門科目」において，化学工学のコア科目である流体工学，伝熱工学，拡散工学，物理化学，反応工学，単位操作を修得するとともに，環境・バイオ・材料に関連する学際科目を学びます。 このことで自然システムのなかでの、物質・エネルギーの創製、移動、再利用やその工業的利用などを通じた物質循環工学の専門知識を学びます。

３年次の実験科目として、前期・後期に「物質循環工学実験」が開講され、より専門的な知識を体得します。また「プロセス創成」では身の回りの化学製品を取り上げ、グループで新製品のアイデアや評価試験などを行います。さらに、工場見学やインターンシップ実習など、実際の製造現場に接する機会も増え、いよいよ実践的なステージに入ります。